Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Rpa3-201ENSMUST00000012627 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 AC154616.1-201ENSMUST00000226995 804 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Farp1F8VPU2 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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