Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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H2-M1F7CXU4 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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H2-M1F7CXU4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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H2-M1F7CXU4 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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H2-M1F7CXU4 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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H2-M1F7CXU4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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H2-M1F7CXU4 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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H2-M1F7CXU4 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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H2-M1F7CXU4 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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H2-M1F7CXU4 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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H2-M1F7CXU4 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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H2-M1F7CXU4 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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H2-M1F7CXU4 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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H2-M1F7CXU4 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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H2-M1F7CXU4 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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H2-M1F7CXU4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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H2-M1F7CXU4 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
H2-M1F7CXU4 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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H2-M1F7CXU4 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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