Protein–RNA interactions for Protein: F7CCV5

Gm3443, Predicted gene 3443, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3443F7CCV5 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm3443F7CCV5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms