Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9S8

Gm2564, C-C motif chemokine, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2564F6Z9S8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm2564F6Z9S8 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms