Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SmgcF6VRN1 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SmgcF6VRN1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SmgcF6VRN1 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SmgcF6VRN1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SmgcF6VRN1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SmgcF6VRN1 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SmgcF6VRN1 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SmgcF6VRN1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SmgcF6VRN1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SmgcF6VRN1 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SmgcF6VRN1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SmgcF6VRN1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SmgcF6VRN1 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SmgcF6VRN1 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SmgcF6VRN1 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SmgcF6VRN1 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SmgcF6VRN1 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SmgcF6VRN1 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SmgcF6VRN1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SmgcF6VRN1 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SmgcF6VRN1 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SmgcF6VRN1 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SmgcF6VRN1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SmgcF6VRN1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SmgcF6VRN1 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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