Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm8247F6VRJ8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms