Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Syngap1F6SEU4 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms