Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm20518E9Q548 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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