Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4V7

Gm17727, Predicted gene, 17727, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17727E9Q4V7 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
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Gm17727E9Q4V7 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Gm17727E9Q4V7 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Gm17727E9Q4V7 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Gm17727E9Q4V7 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Gm17727E9Q4V7 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Gm17727E9Q4V7 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Gm17727E9Q4V7 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm17727E9Q4V7 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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