Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2A2

Gm38392, Predicted gene, 38392 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm38392E9Q2A2 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm38392E9Q2A2 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms