Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Brd1E9PZ26 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Brd1E9PZ26 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms