Protein–RNA interactions for Protein: E9PWP9

4931408C20Rik, RIKEN cDNA 4931408C20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931408C20RikE9PWP9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4931408C20RikE9PWP9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms