Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Vpreb3D3Z6J4 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms