Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AU015836B2RUM3 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AU015836B2RUM3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms