Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Apol7aB2RT54 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms