Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm6880A3KG45 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6880A3KG45 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms