Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnf39A2RT81 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnf39A2RT81 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rnf39A2RT81 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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