Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scn3aA2ASI5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms