Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frmpd1A2AKB4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms