Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pramel3A2AHA7 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramel3A2AHA7 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms