Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Calcoco2A2A6M5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Calcoco2A2A6M5 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Calcoco2A2A6M5 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Calcoco2A2A6M5 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Calcoco2A2A6M5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Calcoco2A2A6M5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Calcoco2A2A6M5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Calcoco2A2A6M5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Calcoco2A2A6M5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Calcoco2A2A6M5 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Calcoco2A2A6M5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Calcoco2A2A6M5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Calcoco2A2A6M5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Calcoco2A2A6M5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Calcoco2A2A6M5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Calcoco2A2A6M5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Calcoco2A2A6M5 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Calcoco2A2A6M5 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Calcoco2A2A6M5 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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