Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Vstm4T1NXB5 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vstm4T1NXB5 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms