Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Knop1Q9Z2Q2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms