Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd3Q9Z2D8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms