Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1R4

D17h6s53e, Uncharacterized protein C6orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17h6s53eQ9Z1R4 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
D17h6s53eQ9Z1R4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms