Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn9Q9Z0S7 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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