Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnip1Q9WUU8 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms