Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Trpc2Q9R244 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Trpc2Q9R244 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Trpc2Q9R244 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Trpc2Q9R244 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Trpc2Q9R244 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Trpc2Q9R244 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Trpc2Q9R244 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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