Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms