Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek3Q9R0A5 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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