Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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