Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

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Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Col4a4Q9QZR9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Col4a4Q9QZR9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Col4a4Q9QZR9 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Col4a4Q9QZR9 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Col4a4Q9QZR9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Col4a4Q9QZR9 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Col4a4Q9QZR9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Col4a4Q9QZR9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Col4a4Q9QZR9 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Col4a4Q9QZR9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Col4a4Q9QZR9 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Col4a4Q9QZR9 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Col4a4Q9QZR9 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Col4a4Q9QZR9 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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