Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VapbQ9QY76 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms