Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms