Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrfQ9JM73 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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