Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Dclk1Q9JLM8 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms