Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tlr5Q9JLF7 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms