Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna1fQ9JIS7 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1fQ9JIS7 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms