Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK3

Capn10, Calpain-10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn10Q9ESK3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn10Q9ESK3 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn10Q9ESK3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capn10Q9ESK3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capn10Q9ESK3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capn10Q9ESK3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Capn10Q9ESK3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capn10Q9ESK3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Capn10Q9ESK3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capn10Q9ESK3 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capn10Q9ESK3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capn10Q9ESK3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capn10Q9ESK3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Capn10Q9ESK3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms