Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Hmgn3Q9DCB1 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hmgn3Q9DCB1 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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