Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBX3

Susd2, Sushi domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 820 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd2Q9DBX3 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Susd2Q9DBX3 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms