Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Serpini2-201ENSMUST00000039047 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Lrriq3-203ENSMUST00000194376 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Csn3-202ENSMUST00000113267 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 2210414B05Rik-201ENSMUST00000139600 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Obox4-ps1-201ENSMUST00000184446 700 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Gm37401-201ENSMUST00000192053 347 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 1700042O05Rik-201ENSMUST00000219017 584 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 AC166830.1-201ENSMUST00000224201 533 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Gm23448-201ENSMUST00000083151 104 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Cpxcr1-201ENSMUST00000101269 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Zfp983-201ENSMUST00000039726 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Gm12735-201ENSMUST00000146218 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Vmn1r-ps57-201ENSMUST00000174879 288 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Gm42509-201ENSMUST00000197390 781 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Gm44181-201ENSMUST00000203106 483 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Gm45437-202ENSMUST00000211418 694 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Glipr1l3-201ENSMUST00000220085 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Lilrb4a-215ENSMUST00000220182 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Gm5087-204ENSMUST00000225820 645 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Riok3Q9DBU3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms