Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc89Q9DA73 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc89Q9DA73 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms