Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ifi35Q9D8C4 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifi35Q9D8C4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ifi35Q9D8C4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifi35Q9D8C4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ifi35Q9D8C4 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ifi35Q9D8C4 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifi35Q9D8C4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifi35Q9D8C4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ifi35Q9D8C4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifi35Q9D8C4 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifi35Q9D8C4 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifi35Q9D8C4 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifi35Q9D8C4 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ifi35Q9D8C4 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifi35Q9D8C4 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ifi35Q9D8C4 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifi35Q9D8C4 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifi35Q9D8C4 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifi35Q9D8C4 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifi35Q9D8C4 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifi35Q9D8C4 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifi35Q9D8C4 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifi35Q9D8C4 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifi35Q9D8C4 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifi35Q9D8C4 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifi35Q9D8C4 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifi35Q9D8C4 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifi35Q9D8C4 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifi35Q9D8C4 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifi35Q9D8C4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifi35Q9D8C4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifi35Q9D8C4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifi35Q9D8C4 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifi35Q9D8C4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifi35Q9D8C4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifi35Q9D8C4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifi35Q9D8C4 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifi35Q9D8C4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifi35Q9D8C4 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifi35Q9D8C4 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifi35Q9D8C4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifi35Q9D8C4 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifi35Q9D8C4 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifi35Q9D8C4 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifi35Q9D8C4 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifi35Q9D8C4 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifi35Q9D8C4 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifi35Q9D8C4 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifi35Q9D8C4 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifi35Q9D8C4 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifi35Q9D8C4 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifi35Q9D8C4 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms