Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Chmp4bQ9D8B3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms