Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slx4ipQ9D7Y9 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slx4ipQ9D7Y9 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms