Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Cldn22Q9D7U6 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Cldn22Q9D7U6 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Cldn22Q9D7U6 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Cldn22Q9D7U6 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Cldn22Q9D7U6 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Cldn22Q9D7U6 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Cldn22Q9D7U6 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Cldn22Q9D7U6 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Cldn22Q9D7U6 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Cldn22Q9D7U6 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Cldn22Q9D7U6 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn22Q9D7U6 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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