Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tube1Q9D6T1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms