Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E4

Drc3, Dynein regulatory complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Drc3Q9D5E4 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Drc3Q9D5E4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms