Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trim42Q9D2H5 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Trim42Q9D2H5 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
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Trim42Q9D2H5 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim42Q9D2H5 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim42Q9D2H5 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim42Q9D2H5 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Trim42Q9D2H5 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim42Q9D2H5 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim42Q9D2H5 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim42Q9D2H5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim42Q9D2H5 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim42Q9D2H5 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim42Q9D2H5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim42Q9D2H5 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim42Q9D2H5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim42Q9D2H5 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim42Q9D2H5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim42Q9D2H5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim42Q9D2H5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim42Q9D2H5 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim42Q9D2H5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim42Q9D2H5 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim42Q9D2H5 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim42Q9D2H5 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim42Q9D2H5 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim42Q9D2H5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim42Q9D2H5 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim42Q9D2H5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim42Q9D2H5 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim42Q9D2H5 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim42Q9D2H5 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trim42Q9D2H5 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim42Q9D2H5 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim42Q9D2H5 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim42Q9D2H5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trim42Q9D2H5 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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